Khu bảo tồn thiên nhiên đất ngập nước này gồm 2 phân vùng là Ô Lâu, Cồn Tè – Rú Chá và 23 khu bảo vệ nguồn lợi thủy sản, nằm trong ranh giới hành chính của 23 xã, thị trấn thuộc 5 huyện trên địa bàn tỉnh Thừa Thiên Huế, với tổng diện tích khu bảo tồn là 2.071,5ha.
Việc thành lập khu bảo tồn đất ngập nước này nhằm phục hồi sinh cảnh, các hệ sinh thái đặc thù, đa dạng sinh học và nguồn lợi thủy sản của đầm phá Tam Giang – Cầu Hai, gồm hệ sinh thái thảm cỏ biển tại khu vực Cồn Tè (Hương Trà); thảm thủy sinh nước ngọt tại cửa sông Ô Lâu (Phong Điền); hệ sinh thái rừng ngập mặn tại khu vực Rú Chá (Hương Trà).
Việc thành lập Khu bảo tồn giúp cho việc giữ gìn và phát huy hết tiềm năng của vùng phá Tam Giang – Cầu Hai, đặc biệt trong việc đẩy mạnh các tour du lịch về đây.