Du thuyền có 27 phòng ngủ, được chia làm ba loại. Nếu như các phòng superia là sự kết hợp giữa phong cách Á và Âu, nhưng mang đậm dấu ấn Pháp với tông màu xanh dương nhẹ nhàng thì các phòng deluxe lại có xu hướng thiên về nét truyền thống của châu Á với vẻ ấm cúng của đồ gỗ màu nâu sẫm, tường sơn màu đồng và những bộ đèn sang trọng. Đáng chú ý là hai phòng suite. Nếu thiết kế của phòng Bảo Đại đậm dấu ấn châu Á hơn cả, lại thể hiện được tính cung đình nhờ mảng tường vẽ rồng, đồ gỗ chạm trổ công phu thì phòng Khmer thể hiện những họa tiết đặc trưng của dân tộc Khmer trên đèn và chân đèn, trên tấm phủ trang trí giường, đặc biệt là bức phù điêu vũ nữ Aspara ở mảng tường đầu giường ngủ…
Thuộc đẳng cấp năm sao, du thuyền Jayavarman có đầy đủ các không gian chức năng với đủ tiện nghi cao cấp, bao gồm các khu lounge, restaurant, quầy bar, spa, jacuzzi… Để làm mờ đi hạn chế có tính khách quan là các khu vực ở trên tàu đều có khoảng cách giữa sàn và trần khá thấp, người thiết kế đã tạo ra các không gian sang trọng, khiến người ta chú ý nhiều hơn đến các chi tiết và bị “thôi miên” bởi vẻ đẹp tổng thể. Nếu để ý sẽ thấy trên du thuyền này, mọi thứ đều được chăm chút rất kỹ lưỡng, mọi vật dụng từ lớn đến nhỏ đều được thiết kế riêng. Nhờ vậy, chỉ bỏ thời gian ngắm các vật dụng xung quanh, du khách đã đi từ thú vị này đến thú vị khác. Thiết kế đặc biệt khai thác yếu tố tầm nhìn nên đã chủ ý để mở không gian ở tất cả những khu vực, giúp mọi người trên du thuyền đều dễ dàng ngắm cảnh sông nước, mây trời thơ mộng. Nó thỏa mãn được nhu cầu của hầu hết khách du lịch là ngồi trên du thuyền này tha hồ quan sát dòng sông Mekông và khám phá các vùng văn hóa khác nhau.