Tập đoàn FPT đã sở hữu bằng sáng chế đầu tiên mang tên “Hệ thống nhận biết trạng thái các ngón tay di chuyển và nhấn trên vùng không gian ảo giới hạn” do Cục Sở hữu trí tuệ thuộc Bộ Khoa học và Công nghệ cấp và bảo hộ. Sáng chế này được Viện Nghiên cứu công nghệ của Trường Đại học FPT thực hiện và nộp đơn xin cấp bằng từ tháng 11-2011, thuộc lĩnh vực giao diện người dùng và máy tính, đề cập đến thiết bị hỗ trợ người dùng tương tác, điều khiển máy tính và các máy móc có kết nối internet thông qua các động tác chuyển động của ngón tay trong một vùng không gian phía trước thiết bị thay cho việc điều khiển trên bàn phím vật lý.
Nhằm cổ vũ hoạt động nghiên cứu khoa học, từ năm 2011, Trường Đại học FPT đã triển khai chính sách thưởng cho các công trình nghiên cứu khoa học được công bố trên các tạp chí thuộc ISI Journal Standard List và ISI Journal Expanded List. Với mỗi bài báo khoa học đăng trên các tạp chí này, tác giả sẽ được nhận giải thưởng lên đến 40 triệu đồng. Năm 2012, hoạt động nghiên cứu khoa học của Viện Nghiên cứu công nghệ tiếp tục ghi dấu ấn với sự kiện chế tạo và thả ra ngoài vũ trụ vệ tinh tự chế đầu tiên của VN mang tên F-1 từ trạm vũ trụ quốc tế ISS.